Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll12Q3UDE2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms