Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtpbp6Q3U6U5 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms