Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Hvcn1Q3U2S8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hvcn1Q3U2S8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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