Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms