Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ccndbp1Q3TVC7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ccndbp1Q3TVC7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ccndbp1Q3TVC7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccndbp1Q3TVC7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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