Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Shcbp1lQ3TTP0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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