Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ctdnep1Q3TP92 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ctdnep1Q3TP92 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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