Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc13Q3TIR1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms