Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccbe1Q3MI99 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccbe1Q3MI99 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccbe1Q3MI99 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ccbe1Q3MI99 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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