Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Trim71Q1PSW8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms