Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpusd2Q149F1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpusd2Q149F1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpusd2Q149F1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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