Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3ip1Q149C2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms