Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc1Q0VDN7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rundc1Q0VDN7 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms