Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubxn2bQ0KL01 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms