Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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F13bQ07968 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
F13bQ07968 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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F13bQ07968 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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F13bQ07968 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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F13bQ07968 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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F13bQ07968 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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F13bQ07968 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
F13bQ07968 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms