Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms