Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp2Q06649 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms