Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cxcr5Q04683 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms