Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms