Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms