Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pkp1P97350 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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