Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NficP70255 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NficP70255 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NficP70255 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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