Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Hoxd13P70217 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd13P70217 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms