Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Acta1P68134 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms