Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
UbdP63072 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
UbdP63072 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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UbdP63072 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
UbdP63072 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms