Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tra2bP62996 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms