Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab3cP62823 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab3cP62823 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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