Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rps29P62274 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms