Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P58686 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
P58686 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P58686 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P58686 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms