Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gsc2P56916 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms