Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

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Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CdaP56389 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CdaP56389 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CdaP56389 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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