Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Aqp4P55088 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms