Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FmodP50608 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms