Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
GdnfP48540 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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