Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ItgavP43406 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms