Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Rab5cP35278 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms