Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Hoxc11P31313 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms