Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms