Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VtnP29788 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VtnP29788 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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