Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RxraP28700 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxraP28700 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxraP28700 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RxraP28700 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RxraP28700 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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