Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb9P28076 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms