Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pde6aP27664 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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