Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms