Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VimP20152 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VimP20152 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VimP20152 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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