Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms