Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
P18528 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
P18528 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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P18528 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18528 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18528 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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P18528 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
P18528 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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