Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
P18525 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
P18525 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P18525 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms