Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou4f1P17208 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms