Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RhoP15409 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RhoP15409 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RhoP15409 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RhoP15409 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms