Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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H2-Eb1P04230 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
H2-Eb1P04230 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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